Chi cục Biển và Hải đảo có chức năng giúp Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường tham mưu cho UBND tỉnh thực hiện quản lý nhà nước tổng hợp và thống nhất quản lý các vấn đề về biển, đảo trên địa bàn tỉnh; thực hiện các dịch vụ công theo quy định của pháp luật. Chi cục Biển và Hải đảo chịu sự quản lý, chỉ đạo của Giám đốc Sở; đồng thời, chịu sự chỉ đạo, hướng dẫn về chuyên môn, nghiệp vụ của Tổng cục Biển và Hải đảo Việt Nam thuộc Bộ Tài nguyên và Môi trường; có tư cách pháp nhân, có trụ sở, có con dấu và tài khoản riêng để hoạt động.
Nhiệm vụ và quyền hạn của Chi cục Biển và Hải đảo là tham mưu Giám đốc Sở trình Uỷ ban nhân dân tỉnh: Dự thảo văn bản quy phạm pháp luật, quy hoạch, kế hoạch, chương trình, đề án, dự án quản lý nhà nước tổng hợp và thống nhất quản lý các vấn đề về biển, đảo; Dự thảo văn bản thẩm định các quy hoạch chuyên ngành về khai thác, sử dụng tài nguyên biển và hải đảo, quy hoạch mạng lưới dịch vụ, đề án thành lập khu bảo tồn biển, khu bảo tồn đất ngập nước ven biển thuộc trách nhiệm quản lý của Sở Tài nguyên và Môi trường; Dự thảo văn bản thẩm định hoặc cấp phép các dự án đầu tư công trình trang thiết bị, dự án khai thác, sử dụng tài nguyên biển, ven biển và hải đảo theo quy định của pháp luật.
Ngoài ra, Chi cục Biển và Hải đảo còn: Tổ chức thực hiện các văn bản quy phạm pháp luật, quy hoạch, kế hoạch, chương trình, đề án, dự án, tiêu chuẩn, quy chuẩn kỹ thuật, định mức kinh tế - kỹ thuật trong lĩnh vực biển và hải đảo đã được cấp có thẩm quyền ban hành, phê duyệt; Hướng dẫn nghiệp vụ quản lý nhà nước tổng hợp và thống nhất quản lý các vấn đề về biển, đảo đối với công chức Phòng Tài nguyên và Môi trường cấp huyện; Phối hợp với cơ quan nhà nước có thẩm quyền lập quy hoạch phát triển kinh tế - xã hội, quy hoạch chuyên ngành khai thác, sử dụng tài nguyên các vùng biển, ven biển và hải đảo; Đề xuất việc điều chỉnh các cơ chế, chính sách thu hút, khuyến khích và bảo đảm quyền của tổ chức và công dân trên các đảo tiền tiêu, các đảo ven bờ; Thống kê, đánh giá tài nguyên, tiềm năng và thực trạng khai thác, sử dụng các vùng biển, ven biển, hải đảo; Tổ chức thực hiện các trình tự, thủ tục đăng ký, cấp phép đối với hoạt động khai thác, sử dụng tài nguyên biển và hải đảo của tổ chức, cá nhân theo quy định của pháp luật; Tổ chức quan trắc biến động và dự báo xu thế biến động, xác định các vùng bờ biển dễ bị tổn thương, biến đổi lớn và đề xuất các giải pháp quản lý, bảo vệ bờ biển; Điều tra và kiểm soát ô nhiễm, suy thoái môi trường biển và hải đảo; phối hợp với Chi cục Bảo vệ Môi trường lập báo cáo hiện trạng môi trường biển, hải đảo; Thực hiện nghiên cứu khoa học, ứng dụng phát triển công nghệ biển, ven biển; Thu thập, xây dựng cơ sở dữ liệu về tài nguyên và môi trường biển, hải đảo; Thực hiện các hoạt động hợp tác quốc tế liên quan đến biển và hải đảo; Chủ trì, phối hợp với các cơ quan có liên quan thực hiện phổ biến, giáo dục pháp luật về biển, hải đảo và tuyên truyền, nâng cao nhận thức cộng đồng về quản lý, bảo vệ và khai thác, sử dụng bền vững biển, đảo; Kiểm tra, giám sát và đề xuất xử lý hoặc xử lý theo thẩm quyền các vi phạm theo quy định của pháp luật; chủ trì, phối hợp giải quyết tranh chấp, khiếu nại giữa các tổ chức, cá nhân về khai thác, sử dụng tài nguyên và bảo vệ môi trường biển, hải đảo ở địa phương theo thẩm quyền được phân cấp;
Về cơ cấu tổ chức và biên chế có lãnh đạo Chi cục gồm Chi cục trưởng và không quá 02 Phó Chi cục trưởng. Chi cục có 3 Phòng chuyên môn nghiệp vụ: Phòng Hành chính - Tổng hợp; Phòng Quản lý Biển, Đảo; Phòng Điều tra và quy hoạch biển, đảo.
Phòng có Trưởng phòng, Phó Trưởng phòng. Trưởng phòng, Phó Trưởng phòng do Chi cục trưởng bổ nhiệm, miễn nhiệm theo quy định phân công, phân cấp hiện hành của UBND tỉnh. Nhiệm vụ, quyền hạn và tổ chức của các phòng thuộc Chi cục Biển và Hải đảo do Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường quy định theo đề nghị của Chi cục trưởng./.